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減少前期生長時間,用一種準(zhǔn)確的圓盤擴(kuò)散法進(jìn)行抗菌敏感試驗(yàn)

2024-07-09 16:47:50

圓盤擴(kuò)散是一種測定微生物抗菌藥物敏感性的標(biāo)準(zhǔn)方法。盡管它有優(yōu)勢,但使用圓盤擴(kuò)散試驗(yàn)作為常規(guī)抗菌藥物敏感性試驗(yàn)(AST)方法的一個潛在缺點(diǎn)是它相對較慢。臨床和實(shí)驗(yàn)室標(biāo)準(zhǔn)研究所(CLSI)規(guī)定,用于圓盤擴(kuò)散試驗(yàn)的接種物(直接菌落懸液的0.5McF標(biāo)準(zhǔn))應(yīng)在非選擇性瓊脂平板上培養(yǎng)18-24小時的菌落中進(jìn)行制備。使用18-24小時生長來準(zhǔn)備初始測試接種物的建議,在很大程度上是基于人類工作日的規(guī)范,以及歷史上大多數(shù)臨床微生物實(shí)驗(yàn)室只在白班期間工作的情況。因此,建立培養(yǎng)物或傳代培養(yǎng)過夜,然后在第二天進(jìn)行AST。隨著微生物學(xué)檢測規(guī)范的變化,是時候在建立AST之前重新檢查18小時培養(yǎng)的需要了。減少測試準(zhǔn)備的時間間隔將是一種相對簡單和非常便宜的方法,可以更快地提供AST結(jié)果,并且可能非常適合于陽性血培養(yǎng)的AST檢測,而得到結(jié)果的時間是至關(guān)重要的。

因此推薦這篇文章給大家,希望能對大家有所幫助。

Stop Waiting for Tomorrow: Disk Diffusion Performed on Early Growth Is an Accurate Method for Antimicrobial Susceptibility Testing with Reduced Turnaround Time

 

內(nèi)容

摘要圓盤擴(kuò)散是一種緩慢但可靠的測定微生物抗菌藥物敏感性的標(biāo)準(zhǔn)方法。我們的目標(biāo)是通過減少培養(yǎng)物在建立圓盤擴(kuò)散測試前的培養(yǎng)時間,來提高這種方法的周轉(zhuǎn)時間。初始方法開發(fā),選擇臨床分離菌株(n=13)和質(zhì)量控制菌株(n=8)的細(xì)菌接種于血瓊脂35℃培養(yǎng)6、1024小時使用一組臨床適當(dāng)?shù)目咕幬镞M(jìn)行圓盤擴(kuò)散測試。圓盤擴(kuò)散區(qū)大小采用臨床和實(shí)驗(yàn)室標(biāo)準(zhǔn)研究所(CLSI)指南進(jìn)行指導(dǎo)。與標(biāo)準(zhǔn)的24小時培養(yǎng)相比,前期6小時生長有1.3%的主要錯誤(MEs)和1.9%的非常嚴(yán)重的錯誤(VMEs,而10小時生長產(chǎn)生0.7%MEs,沒有VMEs。在6h96.7%)和10h96.7%)的生長過程中,與標(biāo)準(zhǔn)培養(yǎng)的分類一致性相似。從6hr2 = 0.98)和10hr2 = 0.99)生長的抑制區(qū)大小與標(biāo)準(zhǔn)條件下的結(jié)果密切相關(guān)。基于這些結(jié)果,作者在優(yōu)化條件下(6h生長)進(jìn)行了圓盤擴(kuò)散,使用了另外100株臨床分離株,顯示了高水平的分類一致性(950次測量中的917[96.5%]95%CI,95.2-97.5%),以及沒有VMEsMEs與標(biāo)準(zhǔn)培養(yǎng)相比,使用早期生長進(jìn)行圓盤擴(kuò)散測試是一種簡單而準(zhǔn)確的敏感性測試方法,可以減少18小時,不需要額外的供應(yīng)成本或設(shè)備儀器。

 

結(jié)果:

分離生長:結(jié)果顯示血瓊脂平板培養(yǎng)6小時缺乏增長,主要是在第一個或兩個象限,而血瓊脂板培養(yǎng)10h顯示在所有四個象限的增長,以及大多數(shù)情況下存在單獨(dú)菌落。盡管6小時生長有限,但6小時平板上有足夠的細(xì)菌,使0.5MCF標(biāo)準(zhǔn)懸液用于所有603個圓盤擴(kuò)散試驗(yàn)。


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不同方法之間的分類一致性:所有603EDD6試驗(yàn)、603EDD10試驗(yàn)和603St24試驗(yàn)均可產(chǎn)生圓盤擴(kuò)散區(qū)。三分之一(366項(xiàng)中的122項(xiàng))的臨床試驗(yàn)在標(biāo)準(zhǔn)條件下對所評估的抗菌素具有耐藥性。對早期和標(biāo)準(zhǔn)生長的AST結(jié)果進(jìn)行比較發(fā)現(xiàn),603項(xiàng)試驗(yàn)中有583項(xiàng)(96.7%;95%CI,94.9-97.8)在EDD6St24之間一致,EDD10St24之間的試驗(yàn)次數(shù)(603583項(xiàng))一致(表23)。EDD61.9%VME95%CI,0.5-5.6%)和1.3%ME (95% CI0.6-2.9%St24相比(表2),而EDD10沒有VME0.7%ME95%CI,0.2-1.9%)(表3。EDD6的三個VME結(jié)果包括EDD6St24對金黃色葡萄球菌的抑制有1mm的差異,EDD6St24重復(fù)對陰溝腸桿菌的抑制有4-6-mm的差異。

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不同方法之間的定量一致性早期盤擴(kuò)散與標(biāo)準(zhǔn)盤擴(kuò)散的比較(線性回歸)顯示,EDD6r 2 = 0.98)和EDD10r 2 = 0.99)與早期生長的盤擴(kuò)散試驗(yàn)高度相關(guān)(圖2AC)。布蘭德阿爾特曼分析(圖2D)顯示,與標(biāo)準(zhǔn)圓盤擴(kuò)散(EDD - St24)相比,EDD6(平均差-0.46 mm;95% CI-0.56-0.35mm)EDD10(平均差-0.42 mm;95% CI-0.51-0.33)的偏差相對較小。如圖3所示,早期和標(biāo)準(zhǔn)的圓盤擴(kuò)散方法之間的差異是由于屎腸桿菌中EDD6的抗菌區(qū)尺寸較?。ㄆ骄?/span>-0.51 mm;95%CI,-0.81-0.22)和金黃色葡萄球菌分離株(平均差-1.14 mm95%CI,-1.33-0.96),以及EDD10的抗菌區(qū)大?。ㄆ骄?/span>-0.70 mm;95%CI,-0.90-0.50),糞腸桿菌(平均差-0.22 mm95%CI,-0.40-0.04)和金黃色葡萄球菌分離株(平均差-0.81 mm;95%CI,-0.96-0.65)

當(dāng)通過細(xì)菌種類評估結(jié)果時,EDD6EDD10St24之間的中位抗菌抑制作用的差異不超過1-mm。值得注意的是,當(dāng)將EDD6EDD10與標(biāo)準(zhǔn)圓盤擴(kuò)散進(jìn)行比較時,7種細(xì)菌中有5種具有相同的中位區(qū)大小(圖3)。與St24相比,EDD6生長的69AST結(jié)果中有67個(97%EDD10中的66個(96%)分離藥物組合的區(qū)域大小在1mm內(nèi)一致。

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用優(yōu)化的方法評價臨床菌株基于這種初始方法優(yōu)化的結(jié)果,作者試圖評估100個臨床相關(guān)分離株的6小時早期圓盤擴(kuò)散試驗(yàn)的準(zhǔn)確性,并使用適當(dāng)?shù)目咕姘暹M(jìn)行測試。綜合結(jié)果,采用標(biāo)準(zhǔn)方法(St24)檢測的360種革蘭陽性分離藥物組合中有38.1%耐藥,590種革蘭陰性分離藥物組合中有41.9%耐藥(St24法)。比較早期(EDD6)和標(biāo)準(zhǔn)增長(St24)的AST結(jié)果,發(fā)現(xiàn)高水平的分類一致性(950/917[965.5%];95% CI95.295.5%),以及低水平的非常重大誤差(0/306[0%];95% CI01.2%),主要誤差(0/644[0%];95% CI,00.6%),還有一些小錯誤(950個中的33[3.5%];95% CI,2.5-4.8%),如圖4(抗菌區(qū)大小相對于敏感性斷點(diǎn))和表4(早期和標(biāo)準(zhǔn)生長之間的分類一致性)所示。

88種分離藥物組合的區(qū)域大小進(jìn)行了比較,88種組合中8596.6%EDD6ST24平均差異之間不到2毫米,只有三個隔離藥物組合有2毫米的差異,包括氯霉素-VRE,呋喃妥因和對紅霉素-甲氧西林敏感的金黃色葡萄球菌MSSA,平均差異-2-22.5毫米(EDD6-St24)。

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討論

更快的抗菌藥物敏感性試驗(yàn)可以提供更好的臨床結(jié)果和改善抗菌藥物管理。這種對速度的需求促使了最的發(fā)展,包括快速表型和遺傳易感性檢測,24小時微生物實(shí)驗(yàn)室的人員配備,以及全實(shí)驗(yàn)室自動化。盡管有了這些進(jìn)展,仍然迫切需要一種可靠、低成本的AST方法,該方法可以比傳統(tǒng)方法更快地提供結(jié)果,并可以應(yīng)用在具有各種資源的實(shí)驗(yàn)室中。在此,作者描述了一種簡單而經(jīng)濟(jì)有效的對圓盤擴(kuò)散測試的修改,它有可能加快AST結(jié)果的報告。

雖然縮短早期生長時間和標(biāo)準(zhǔn)圓盤擴(kuò)散方法的檢測結(jié)果高度一致,但作者觀察到與St24相比,EDD偏?。ㄐ∮?/span>0.5 mm)。但總的來說EDD6EDD10的結(jié)果與標(biāo)準(zhǔn)圓盤擴(kuò)散試驗(yàn)高度一致。早期的圓盤擴(kuò)散測試在一系列微生物、抗生素類別和耐藥性模式上表現(xiàn)良好。測試參數(shù)的多樣性可以通過生物體的選擇來證明,其中包括常規(guī)QC菌株和更具挑戰(zhàn)性的臨床分離株,在已建立的斷點(diǎn)附近有抑制區(qū)。

該方法也顯示了較低的技術(shù)故障率。所有來自EDD6EDD10St24的重復(fù)都是可評估的,沒有技術(shù)失敗?;谶@些結(jié)果(對21株分離株和適當(dāng)?shù)目股剡M(jìn)行EDD6EDD10檢測),作者對另外100株臨床分離株進(jìn)行了圓盤擴(kuò)散試驗(yàn),分別培養(yǎng)6小時(EDD6)進(jìn)行圓盤擴(kuò)散試驗(yàn)。采用優(yōu)化的方法進(jìn)行的早期圓盤擴(kuò)散試驗(yàn)結(jié)果沒有VMEME,與標(biāo)準(zhǔn)24小時培養(yǎng)的結(jié)果分類一致96.5%,這表明這是一種準(zhǔn)確的抗菌藥物敏感性試驗(yàn)方法,減少了周轉(zhuǎn)時間。

圓盤擴(kuò)散試驗(yàn)是一種簡單、可靠性高的藥敏檢測方法,被廣泛認(rèn)為是AST的標(biāo)準(zhǔn)方法。EDD提供了一種改進(jìn)圓盤擴(kuò)散周轉(zhuǎn)實(shí)驗(yàn)的方法,同時保留了這種眾所周知的方法的有益屬性。建議未來的工作旨在評估EDD納入臨床工作流程時的性能。

總之,使用早期生長進(jìn)行圓盤擴(kuò)散測試是一種簡單而準(zhǔn)確的抗菌藥物敏感性測試方法,可以減少檢測時間多達(dá)18小時,同時對檢測方法不增加額外的成本。這種方法應(yīng)被納入全實(shí)驗(yàn)室自動化或常規(guī)安排第二班和第三班的實(shí)驗(yàn)室所考慮。